Genetiskt ses ofta trisomi 3 och ibland trisomi 18, ingen av dessa aberrationer är dock specifika för MALT lymfom. Klassificeringen och benämningen av dessa skiljer sig åt mellan de båda klassifikationer som publicerades ; ICC c4ee0ecd4d-4dcc-bd0fd 14 och WHO ec6ddbfee12d37ebb3d 15